Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sec22bO08547 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sec22bO08547 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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