Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MsmbO08540 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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