Protein–RNA interactions for Protein: L7N471

Gm7980, Predicted gene 7980 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7980L7N471 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm7980L7N471 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm7980L7N471 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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