Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C0

Gm6401, Predicted gene 6401 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6401L7N2C0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm6401L7N2C0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm6401L7N2C0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm6401L7N2C0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm6401L7N2C0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6401L7N2C0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Gm6401L7N2C0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Gm6401L7N2C0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm6401L7N2C0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm6401L7N2C0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6401L7N2C0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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