Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1oL7MU04 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms