Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC8.77□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Gm21887J3QQ04 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm37396-201ENSMUST00000191827 1495 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm42683-201ENSMUST00000196136 2328 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm37893-201ENSMUST00000192826 2437 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms