Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccer2J3QPU5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccer2J3QPU5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccer2J3QPU5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms