Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shisa8J3QNX5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisa8J3QNX5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisa8J3QNX5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisa8J3QNX5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisa8J3QNX5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisa8J3QNX5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisa8J3QNX5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisa8J3QNX5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisa8J3QNX5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms