Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3336J3QMQ6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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