Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm20834J3QM72 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm20834J3QM72 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm20834J3QM72 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm20834J3QM72 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm20834J3QM72 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm20834J3QM72 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm20834J3QM72 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm20834J3QM72 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm20834J3QM72 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm20834J3QM72 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm20834J3QM72 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm20834J3QM72 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm20834J3QM72 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm20834J3QM72 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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