Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6594J3QM43 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6594J3QM43 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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