Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
4930544D05RikJ3QK56 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
4930544D05RikJ3QK56 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms