Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm20830J3KML6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm20830J3KML6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm20830J3KML6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm20830J3KML6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm20830J3KML6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm20830J3KML6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm20830J3KML6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm20830J3KML6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm20830J3KML6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20830J3KML6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20830J3KML6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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