Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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