Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pot1bH7BX60 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms