Protein–RNA interactions for Protein: H3BKF4

Gm20708, Predicted gene 20708, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20708H3BKF4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm20708H3BKF4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20708H3BKF4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20708H3BKF4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20708H3BKF4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20708H3BKF4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20708H3BKF4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20708H3BKF4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms