Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4bG5E8Z2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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