Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
HrcG5E8J6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HrcG5E8J6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms