Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms