Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zc3h12bG3X9I7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zc3h12bG3X9I7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms