Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms