Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20517G3UVU6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20517G3UVU6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20517G3UVU6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20517G3UVU6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms