Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp72F8VQC1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp72F8VQC1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp72F8VQC1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp72F8VQC1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp72F8VQC1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp72F8VQC1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp72F8VQC1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp72F8VQC1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp72F8VQC1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp72F8VQC1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp72F8VQC1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp72F8VQC1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp72F8VQC1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp72F8VQC1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp72F8VQC1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp72F8VQC1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp72F8VQC1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp72F8VQC1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp72F8VQC1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp72F8VQC1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms