Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NpcdF8VQB8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms