Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ScaperF8VQ70 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ScaperF8VQ70 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms