Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ercc6F8VPZ5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ercc6F8VPZ5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ercc6F8VPZ5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ercc6F8VPZ5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ercc6F8VPZ5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Ercc6F8VPZ5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ercc6F8VPZ5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms