Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms