Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms