Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930451I11RikE9Q9R3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930451I11RikE9Q9R3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930451I11RikE9Q9R3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930451I11RikE9Q9R3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930451I11RikE9Q9R3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930451I11RikE9Q9R3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930451I11RikE9Q9R3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930451I11RikE9Q9R3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930451I11RikE9Q9R3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930451I11RikE9Q9R3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms