Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9N3

Vmn1r152, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r152E9Q9N3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Vmn1r152E9Q9N3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r152E9Q9N3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms