Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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TrdnE9Q9K5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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TrdnE9Q9K5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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TrdnE9Q9K5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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TrdnE9Q9K5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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TrdnE9Q9K5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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TrdnE9Q9K5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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TrdnE9Q9K5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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TrdnE9Q9K5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TrdnE9Q9K5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TrdnE9Q9K5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TrdnE9Q9K5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TrdnE9Q9K5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TrdnE9Q9K5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrdnE9Q9K5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrdnE9Q9K5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrdnE9Q9K5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrdnE9Q9K5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrdnE9Q9K5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrdnE9Q9K5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrdnE9Q9K5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TrdnE9Q9K5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrdnE9Q9K5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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