Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms