Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1iE9Q7P2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms