Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp31E9Q6Y8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp31E9Q6Y8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
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