Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Simc1E9Q6E9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms