Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pgbd1E9Q492 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms