Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms