Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tarbp1E9Q368 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms