Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms