Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdr1E9Q0B4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms