Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3095E9Q058 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms