Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9972E9Q053 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm9972E9Q053 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm9972E9Q053 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm9972E9Q053 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm9972E9Q053 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm9972E9Q053 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm9972E9Q053 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm9972E9Q053 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm9972E9Q053 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm9972E9Q053 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm9972E9Q053 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm9972E9Q053 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms