Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ddx60E9PZQ1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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