Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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