Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms