Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chd2E9PZM4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd2E9PZM4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms