Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sfta2E9PXB6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms