Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms