Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms