Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms